Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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