Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd8Q9CX56 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd8Q9CX56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms