Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkrip1Q9CWV6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms