Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms