Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MINDY3Q9CV28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MINDY3Q9CV28 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms