Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sycp2Q9CUU3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sycp2Q9CUU3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sycp2Q9CUU3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms