Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb3Q9CTN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms