Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms