Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.5 ms