Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PclafQ9CQX4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms