Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms