Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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