Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2Q9CQP2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
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