Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpb2Q9CQI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms