Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem216Q9CQC4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms