Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms