Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11bQ99PV8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11bQ99PV8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms