Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scd3Q99PL7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms