Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrbp1Q99PL5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms