Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms