Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl3Q99N95 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms