Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brms1Q99N20 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brms1Q99N20 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms