Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf17Q99MV7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms