Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pink1Q99MQ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms