Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CalcbQ99MP3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CalcbQ99MP3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms