Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp4Q99ME9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp4Q99ME9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms