Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b4Q99ME6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms