Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tm2d1Q99MB3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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