Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnps1Q99M28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnps1Q99M28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnps1Q99M28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnps1Q99M28 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnps1Q99M28 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnps1Q99M28 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnps1Q99M28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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