Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms