Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms