Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms