Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chst12Q99LL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chst12Q99LL3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms