Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms