Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lactb2Q99KR3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms