Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms