Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dok4Q99KE3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms