Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms