Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms