Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrabdQ99JY4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms