Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf11Q99JX1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms