Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims1Q99JW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms