Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms