Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spef1Q99JL1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms