Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdelr1Q99JH8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kdelr1Q99JH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms