Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms