Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddb2Q99J79 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ddb2Q99J79 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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