Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan1Q99J59 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan1Q99J59 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms