Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Ctu1Q99J10 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ctu1Q99J10 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ctu1Q99J10 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu1Q99J10 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ctu1Q99J10 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ctu1Q99J10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms