Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms